La Team Plasma fait encore des siennes avec la machine à contrôler les Pokémon. Un Tranchodon, victime de Nikolaï, détruit tout sur son passage.
Avec l'aide de ses amis Iris et Rachid, Sacha a déjoué les derniers plans machiavéliques de la Team Rocket. Avec ses huit Badges d'Arène en poche, Sacha va tenter de relever le plus grand défi de la région, la Ligue d'Unis, où il affrontera d'anciens rivaux et de nouveaux adversaires, dans sa quête pour devenir Maître Pokémon.