Un homme commet un braquage pour se faire incarcérer à la prison de Fox River. Il espère y retrouver son frère, condamné à mort, et l'aider à s'évader.
Jugé pour avoir braqué une banque, Michael ne fait rien pour se défendre. Son amie et avocate, Veronica, ne comprend pas son attitude. Mais Michael n'a pas le choix. Son frère Lincoln croupit dans les couloirs de la mort pour un meurtre qu'il n'a pas commis. Michael veut le retrouver pour l'aider à s'évader. Une fois incarcéré, Michael cherche à entrer en contact avec lui. Il fait la connaissance de Fernando, son compagnon de cellule, qui lui donne des informations sur le fonctionnement de la prison. Pendant ce temps, un agent des services secrets tente d'intimider un évêque qui croit en l'innocence de Lincoln...