Les détenus sont parvenus à s'évader, mais au prix de la mort de l'un d'entre eux et de la capture d'un autre. Les recherches sont lancées pour les retrouver.
Les sept détenus ont réussi à s'échapper de Fox River, laissant derrière eux le cadavre de Westmoreland et Manche aux mains des gardiens. L'alerte générale retentit. L'équipe, délestée de Haywire, puis de Tweener et de T-Bag, tente d'atteindre l'aéroport pour s'enfuir grâce à l'avion d'Abruzzi. Pope et Bellick sont furieux de constater leur impuissance à les retrouver. Ce dernier les prend en chasse. Veronica trouve enfin la preuve qui pourra innocenter Lincoln. Elle comprend aussi que la vice-présidente complote avec Kellerman. Celle-ci réalise qu'elle est en train de perdre l'autorité qu'elle exerçait, et que le poste de présidente paraît compromis...