Le professeur Layton et Luke viennent en aide à une jeune cantatrice, persuadée d'avoir vu le fantôme de son amie défunte dans les couloirs de l'opéra.
Gentleman britannique et célèbre professeur d'archéologie à l'université Gressenheller de Londres, le professeur Layton est un passionné d'énigmes. Un nouveau mystère l'attend lorsque la jeune cantatrice Jenis Quatlane lui confie avoir aperçu le spectre de sa meilleure amie. Layton et Luke enquêtent...