Six mois après l'accident nucléaire, Neville cherche sa femme en compagnie de Jason tandis que Charlie a pris le large. Rachel est rongée par la culpabilité.
Six mois se sont écoulés depuis que les missiles ont rasé Atlanta et Philadelphie de la carte. Aaron n'a pu rétablir l'électricité que pendant quelques minutes. Miles et Rachel vivent désormais à Willoughby, au Texas, chez le docteur Gene Porter, le père de Rachel. Rongée par la culpabilité, celle-ci se remet lentement des évènements survenus à la Tour. Charlie a pris le large pour suivre son propre chemin et traquer Monroe. Quant à Neville, il ratisse les camps de réfugiés en compagnie de son fils, dans l'espoir de retrouver son épouse disparue...