Alors que Scooby-Doo et ses amis profitent d'un voyage dans l'espace, ils sont bientôt confrontés à un mystérieux extraterrestre.
Après avoir gagné leurs places à une loterie, Scooby-Doo et ses amis s'envolent pour l'espace dans le vaisseau spatial d'un Baron milliardaire. Lorsqu'un extraterrestre belliqueux vient saboter la navette, l'équipage est contraint d'atterrir sur la base du Baron située sur le côté obscur de la lune...