Après être tombés en panne dans le désert, Scooby-Doo et ses amis rencontrent des extraterrestres animés d'intentions peu amicales à l'égard des Terriens.
Scooby-Doo, Sammy, et leur bande d'amis habituels font du tourisme dans le désert à bord de leur van. Soudain, le véhicule tombe en panne au beau milieu de nulle part. Après une marche exténuante, ils parviennent à rejoindre une bourgade où, à leur grande surprise, se tient un grand congrès d'ufologie...