Nadat hij het leven van hun troonopvolger heeft gered, wordt de eigenzinnige krijger Snake Eyes opgenomen door een oude Japanse clan, genaamd Arashikage.
Nadat hij het leven van hun troonopvolger heeft gered, wordt de eigenzinnige krijger Snake Eyes opgenomen door een oude Japanse clan, genaamd Arashikage. Bij hen wordt hij een echte ninjakrijger en vindt Snake Eyes iets wat hij al lang heeft moeten missen: een thuis.