En tentant de se débarrasser d'un hôte importun, une souris domestique se retrouve dans les égouts de la ville. Elle y découvre une cité souterraine.
Roddy Saint-James est une souris domestique qui vit dans un appartement des beaux quartiers, entourée de l'affection de ses maîtres. Quand ces derniers partent en vacances, il s'imagine qu'il va pouvoir profiter pleinement de tout cet espace vide pour s'amuser. Mais un soir, il entend un bruit et découvre, dans la cuisine, Sid, un rat rondouillard et joyeux qui appartient au monde des égouts. Pour s'en débarrasser, il l'attire dans un piège et lui fait croire que la cuvette des WC est un jacuzzi. Mais Sid n'est pas si bête. D'un geste, il y précipite Roddy, qui se retrouve dans les égouts. Là, il découvre avec surprise Souris City...
Produit par la compagnie qui avait déjà réalisé "Wallace et Gromit", un film d'animation remarquable, au rythme soutenu.