En 2199, la Terre est irradiée par des extraterrestres. Les humains vivent sous terre, jusqu'au jour où un pilote entreprend un voyage qui pourrait les sauver.
En 2199, cinq ans après les premières attaques de Gamilas sur la Terre, la planète a été irradiée par les extraterrestres et les humains sont désormais obligés de vivre sous terre. Un jour, Susumu Kodai, ancien pilote, découvre une capsule en provenance de la planète Iskander, qui pourrait sauver la Terre...