Ba'al réussit à remonter le temps et à modifier le passé : le programme Stargate n'a jamais existé. Bientôt, les vaisseaux Goa'uld se massent près de la Terre.
Le dernier clone de Ba'al a été capturé. Les membres de SG-1 assistent à l'extraction du symbiote, mais la cérémonie tourne mal, et tout le monde se met à disparaître. Carter, Mitchell et Jackson se rendent à la Porte des étoiles. Soudain, ils se retrouvent dans l'Arctique. Ba'al a modifié le passé...