Le colonel O'Neill se réveille après avoir été congelé dans un sarcophage : il apprend que les autres membres de SG-1 sont morts pendant son transfert.
Jack O'Neill est tiré par des inconnus d'un caveau étanche, dans lequel il avait été congelé. Il apprend que ce caisson avait été réexpédié à la base dix ans plus tôt, et que tous ses camarades de SG-1 ont péri au cours de cette mission. Jack est dubitatif, mais il se trouve bien sur la base qu'il a toujours connue. Seul le personnel semble avoir changé. Questionné par les médecins au sujet des rebelles qui sont en mesure de détruire les Goa'ulds, il livre quelques renseignements, mais se méfie. Il finit par comprendre que le SGC n'est qu'une copie du véritable centre terrien et qu'il fait l'objet d'une machination, ourdie par les Goa'ulds...