Attaqué, le Prométhée se réfugie au coeur d'un nuage de gaz. Après un choc violent, Sam perd connaissance et, à son réveil, se retrouve seule dans le vaisseau.
Le Prométhée, à bord duquel se trouve Sam, est attaqué subitement par un vaisseau inconnu. Fuyant la menace ennemie, la navette se dissimule dans un nuage de gaz cosmique. Après avoir reçu un choc, Sam fait une chute et perd connaissance. A son réveil, l'équipage s'est volatilisé. Malgré tous ses efforts et en raison des avaries, Sam ne parvient pas à redémarrer le Prométhée, bloqué dans le nuage interstellaire. Perplexe, elle note dans le journal de bord de l'appareil tous les événements survenus depuis son évanouissement. Tour à tour, ses proches amis et son père lui apparaissent pour lui donner des conseils, tous différents et parfois même contradictoires. La plus singulière de ces visions est celle de Grace, une fillette aux propos sibyllins...