L'offensive des Réplicateurs menace la galaxie tout entière. Tandis que Sam développe une arme, Jack et Jacob sont forcés de contracter une alliance avec Ba'al.
Les Réplicateurs lancent une vaste offensive sur les domaines go'aulds, qui disparaissent à vue d'oeil sur les écrans de contrôle. C'est toute la galaxie qui est menacée de destruction. Mis en échec, Ba'al contraint les Jaffas à se soumettre à son autorité et vient solliciter l'aide de Jack. Jacob et Teal'c prennent la tête des troupes jaffas et risquent un assaut de la dernière chance sur le temple de Dakara, lieu symbolique de la domination go'auld. Pendant ce temps, Daniel est capturé par les Réplicateurs, qui veulent sonder ses connaissances sur le rayon disrupteur, seule arme efficace contre eux...