Chandler et l'équipage de l'USS Nathan James rentrent à Baltimore avec le vaccin, qui doit désormais être produit à grande échelle pour éradiquer l'infection.
Maintenant qu'ils disposent du vaccin et du remède contre le virus, surnommé « la grippe rouge », Chandler et l'équipage de l'USS Nathan James rentrent à Baltimore, où politiques et seigneurs de guerre s'affrontent pour garder le contrôle de la ville. Il s'agit désormais de produire le vaccin à grande échelle, pour tenter d'éradiquer le mal. Chandler espère y retrouver sa famille et la sauver avant que l'infection ne les emporte. Il essaie de localiser et contacter ses proches, ignorant que son père a choisi de rejoindre Olympia. Dans le même temps, les troupes de Granderson prennent le contrôle du navire...