En 1993, une jeune fille lesbienne, orpheline depuis peu, est envoyée par sa tante conservatrice suivre une thérapie censée la convertir à l'hétérosexualité.
En 1993, Cameron Post, une orpheline, tombe amoureuse de Coley, une jeune fille qu'elle a rencontrée à l'école du dimanche. Elles vivent pleinement leur relation naissante jusqu'au jour où elles sont surprises dans une voiture lors de la fête de fin d'année. Il n'en faut pas plus à sa tante évangéliste pour l'envoyer à "God's Promise", un établissement dans les Rocheuses, censé lui passer l'envie d'être homosexuelle. Elle découvre un endroit dirigé d'une main de fer par madame Marsh, où les pensionnaires sont programmés à se détester eux-même. Elle se lie d'amitié avec Mark, l'introverti, et Jane, la grande gueule,...
En montrant les ravages des thérapies de "conversion" prétenduement capables de "guérir" l'homosexualité "Come as You Are" propose un hymne à la liberté.