Unicron n'a pas été complètement détruit : il a pris possession du corps de Mégatron et rêve de se venger des Autobots et d'anéantir Cybertron.
Unicron ressuscite et prend possession du corps de Mégatron, afin de se venger des Autobots et finalement, détruire Cybertron. Cet ennemi redoutable force une alliance improbable entre les Autobots, les Decepticons, Prédaking et de nouveaux Predacons, qui se réunissent pour aider à protéger leur planète...