Après une longue absence due à l'épidémie mondiale du Covid, "Une saison au zoo" fait son retour pour une douzième saison qui s'annonce toute particulière.
Paul attend impatiemment son collègue Pich pour nettoyer le bassin des hippopotames, une tâche délicate. Margaux et sa stagiaire Lise collectent des échantillons frais de déjections de différentes espèces pour leurs recherches, guidées par les soigneurs. Pendant ce temps, Sabrina et son équipe, avec les vétérinaires, supervisent la première rencontre entre deux loutres d'Asie destinées à former un couple.