Un des meilleurs agents du FBI, affecté à la résolution d'affaires non classées, se voit adjoindre une coéquipière, une scientifique à l'esprit cartésien.
L'agent Fox Mulder est l'un des meilleurs éléments du FBI. Depuis quelques années, il a largement fait les preuves de sa sagacité dans les affaires les plus délicates. On lui a adjoint les services de Dana Scully, une jeune scientifique de renom. Celle-ci a été chargée par ses supérieurs d'assister l'agent Mulder et d'établir un rapport sur ses activités. En effet, spécialiste des sciences occultes et des affaires criminelles, Mulder s'est mis en tête de résoudre les affaires non élucidées du bureau fédéral. Il a découvert que certaines d'entre elles, concernant des événements paranormaux, présentaient des similitudes troublantes...