La mort étrange d'un jeune homme met le FBI sur la piste d'un transsexuel, issu d'une mystérieuse communauté amish aux origines extraterrestres.
Dans une discothèque branchée de la ville, un jeune homme fait la connaissance d'une ravissante jeune femme. Après s'être épiés et avoir brisé la glace, ils dansent langoureusement avant de décider de passer quelques heures dans une plus grande intimité. Au plus fort de l'étreinte, le jeune homme se met à suffoquer et meurt sous les yeux de sa compagne. Celle-ci, terrifiée, se transforme aussitôt en homme et disparaît. Leur enquête conduit Scully et Mulder jusqu'à Stevenston, dans le Massachusetts, lieu de résidence d'une étrange communauté amish dont les membres pourraient bien être d'origine extraterrestre...