Au moment où la mère de Scully perd espoir, on retrouve sa fille dans un hôpital. Elle est vivante, mais dans un état critique, et semble avoir changé.
Alors que la mère de Scully perd espoir de retrouver sa fille, la partenaire de Mulder est découverte dans un hôpital. Dans le coma, elle est maintenue en vie sous respirateur artificiel. Mulder découvre que son ADN a été modifié et soupçonne le gouvernement d'avoir effectué des expériences sur elle...