De retour sur les lieux de leur première enquête, en Oregon, Mulder et Scully sont à nouveau confrontés à des phénomènes qui dépassent l'entendement.
Mulder et Scully retournent en Oregon, sur les lieux de leur première enquête commune. Tous deux sont pensifs : en sept ans, beaucoup de choses ont changé et ils ne sont plus vraiment les mêmes. Confrontés à des phénomènes qui dépassent l'entendement, ils ont souvent mis leur santé mentale en péril. Une fois encore, leurs investigations les mettent en présence de faits étranges, qui les poussent à désobéir aux ordres de leur hiérarchie...