Tandis que Scully se retrouve à l'hôpital, Doggett enquête sur les meurtres de vingt membres d'une secte et des deux agents du FBI chargés de leur surveillance.
Après le massacre de Waco, au Texas, le FBI est sur le qui-vive. Deux agents ont été chargés de surveiller les faits et gestes d'une organisation religieuse particulièrement louche. Alors qu'ils sont en planque, le premier, Jim Leeds, s'assoupit. Son collègue, Angus Stedman, le réveille pour lui signaler qu'il règne une certaine agitation dans la maison. Ils décident d'y pénétrer, mais ils arrivent trop tard : vingt corps inanimés gisent sur le sol. Stedman sent une présence derrière lui. Il pousse un hurlement, mais quand Leeds arrive, c'est pour trouver l'agent à terre et sans vie. Et quand Stedman se retourne, il constate avec stupeur qu'un homme doté d'un troisième oeil au milieu du front l'observe...