Le passé de Skinner revient le hanter. Alors que Mulder et Scully tentent de le retrouver, leur méfiance croissante à son égard atteint son maximum.
Alvin Kersh, le directeur adjoint du FBI, convoque Mulder et Scully et leur intime l'ordre de retrouver leur ex-patron, Walter Skinner, qui est porté disparu. Les deux agents dénichent quelques indices en fouillant le domicile de Skinner, qui les mènent dans une région isolée. Là, ils découvrent une communauté d'anciens combattants du bataillon de Skinner. Pendant la guerre du Viêtnam, certains d'entre eux auraient été exposés à un gaz hallucinogène développé par l'armée...