Le professeur Hawkins révèle à Yugi ce qu'il sait sur le Pharaon et sur les liens qui les unissent.
Le monde est au bord de l'apocalypse tout comme le monde des Monstres de Duel. Les gardiens de la Terre et du Monde des Monstres doivent s'unir pour affronter le Grand Léviathan qui sème le chaos.