Gon, un jeune garçon aux facultés exceptionnelles, passe l'examen pour devenir un Hunter, l'élite des aventuriers. Il espère ainsi pouvoir retrouver son père, Jin.
Le chef de la Brigade fantôme est mort. Kurapika est sous le choc, mais n'étant pas convaincu, il cherche à vérifier cette rumeur de ses propres yeux. Au même moment, les cadavres des autres membres de la brigade sont découverts...