En mission de colonisation, l'équipage d'un vaisseau spatial atterrit sur une planète inexplorée. Peuplée d'aliens, c'est loin d'être le paradis espéré.
L'équipe du vaisseau Covenant, emmenée par le capitaine Branson et son second Christopher Oram, est envoyée dans l'espace afin de trouver une planète à coloniser. Ils arrivent à bon port et découvrent un havre de paix où aucun humain n'a jamais mis les pieds. Ils ne savent pas que ce territoire inexploré est en fait celui des aliens. Le cauchemar commence lorsque l'un d'eux est contaminé. Alors qu'ils veulent quitter cet enfer, leur navette explose, les condamnant à rester sur place et à lutter de toutes leurs forces pour ne pas perdre la vie...
Un scénario qui s'essouffle dans ce nouvel épisode, qui doit beaucoup à la qualité de jeu de ses interprètes.