La vie continue dans la classe E de Kunugigaoka, mais la fin de l'année approche et les élèves vont devoir faire des choix quant à leur avenir professionnel. Si certains d'entre eux ont une idée claire de ce qu'ils veulent devenir, Nagisa se pose encore beaucoup de questions. De son côté, Irina doute que les gouvernements du monde entier renoncent à éliminer celui qui reste une menace potentielle pour la survie de la Terre...