Les Lyoko-guerriers envisagent de découvrir et de détruire le Supercalculateur qui génère le premier Réplika découvert lors d'une précédente mission dans le réseau. Pour ce faire, Jérémie a mis au point un procédé, appelé "Translation", permettant à ses amis de se matérialiser sur la surface de la Terre sous forme de super Spectre Polymorphe. Tandis que Yumi et Ulrich restent auprès du Skid, Aélita et Odd se retrouvent ainsi en pleine jungle...