Lorsque l'armée de Gengis Khan pénètre à son tour en Perse au XIIIe siècle, elle laisse dans son sillage des villes en ruine. Pour la première fois depuis l'invasion musulmane, la Perse devient une entité distincte du reste du monde musulman. En 1501, les Safavides prennent Tabriz et instaurent, sous Ismail Ier, la conversion du pays au chiisme afin de s'affirmer face à la domination des Ottomans sunnites, qu'ils affrontent jusque dans le Caucase et en Anatolie. Après des siècles de dominations étrangères, au tournant du XXe siècle, les grandes puissances impériales européennes, Grande-Bretagne et Russie en tête, se livrent à leur tour une guerre d'influence pour s'emparer des riches matières premières du pays.