En compagnie de Fumiko Alioune, Cousteau se lance dans une véritable course contre la montre. Dans la lagune de Scammon, véritable sanctuaire où les baleines grises viennent se reproduire, de riches promoteurs immobiliers envisagent de construire un complexe touristique. Jacques-Yves Cousteau est farouchement opposé à ce projet et décide de tout faire pour empêcher sa réalisation. Encore lui faudra-t-il convaincre le juge Diaz que la survie des cétacés est en jeu...