Contraints et forcés, les Thunderman retournent à Hiddenville. Alors qu'ils tentent de reprendre une vie normale, une nouvelle menace plane sur Metroburg.
Pendant des années, les Thunderman ont brillamment combattu le crime à Metroburg. Malheureusement, cette époque heureuse s'achève avec l'arrivée dans la ville d'une nouvelle équipe de super-héros, la V-Team, qui s'avère bien plus efficace qu'eux. Après qu'un sauvetage a mal tourné, la présidente Kickbutt décide de renvoyer les Thunderman à Hiddenville où ils tentent de reprendre une vie normale. Pendant ce temps, les super vilains Dark Mayhem, King Crab et Strongdor élaborent un plan machiavélique pour vaincre la famille de super-héros...