Le meurtre d'un officier portuaire trahit la localisation possible de Parsa. Bishop révèle qu'elle suit le terroriste depuis six ans pour la NSA.
Toujours à la recherche du terroriste Benham Parsa, le NCIS suit la piste d'un corps retrouvé dans un port qui pourrait aider les agents à localiser leur homme. En effet, la description de la victime correspond à celle de l'un des gardes du corps de Parsa. De son côté, Ellie Bishop émet une théorie : le terroriste pourrait rentrer au Pakistan à l'occasion de l'anniversaire du décès de ses parents. Gibbs apprend alors avec étonnement que sa collègue piste Parsa depuis six ans déjà pour le compte de la NSA...