Lois Lane et Jimmy Olson sont attaqués par un fantôme. Ils font appel au Scooby-Gang, l'occasion pour Scooby-Doo de rencontrer Krypto, le chien de Superman.
Depuis que la Ligue des justiciers s'est effondrée, Metropolis n'est plus en sécurité. Quand Lois Lane et Jimmy Olson sont attaqués par un fantôme, ils n'ont d'autre choix que de faire appel aux spécialistes : la société Mystères associés. Dès leur arrivée, Fred, Daphné, Vera et Sammy découvrent une ville en plein chaos. Parvenant à trouver refuge au Daily Planet, ils font la connaissance de Lois et Jimmy, tandis que Scooby-Doo sympathise avec Krypto, le chien de Superman. Or Lex Luthor aussi a un chien, prénommé Rex.
Un crossover qui met en scène le Scooby-Gang dans le monde de Superman, infesté de fantômes à démasquer.