Une fillette appelée Cassandra, unique survivante d'une gigantesque épidémie, est programmée pour détruire la Porte des étoiles que possèdent les Terriens.
L'équipe SG-1 se rend sur la planète P8X987, où une autre équipe SG prépare l'observation d'un trou noir. Sur place, SG-1 se rend compte qu'un mal étrange a décimé la civilisation qui peuplait la zone. Tous les habitants ont disparu, sauf une petite fille appelée Cassandra. Pendant qu'O'Neill et Teal'c restent sur P8X987 pour mener à bien des expériences sur le trou noir, Samantha et Daniel retournent sur Terre avec Cassandra. Carter découvre alors que l'enfant présente une anomalie anatomique. Après analyse, il semble que la fillette a été utilisée par les Goa'ulds pour servir de cheval de Troie et détuire la base terrienne. Carter est partagée entre son affection pour Cassandra et son devoir...