Alors que Sam est toujours prisonnière de Numéro 5, O'Neill et Thor tentent de stopper l'avancée des Réplicateurs sur la planète refuge des Asgards.
Sur son vaisseau, Thor est parvenu à téléporter le corps d'O'Neill et à brancher son esprit sur l'ordinateur de bord. Il espère que Jack pourra construire une arme susceptible de détruire les Réplicateurs. Ceux-ci ont d'ailleurs envahi la planète refuge des Asgards et entendent bien installer leur domination sur toute la galaxie. De son côté, Sam, toujours prisonnière de Numéro 5, se retrouve dans une réalité virtuelle où elle mène une vie de couple avec son ami Pete. Sam comprend vite que Numéro 5 manipule ses pensées. Pendant ce temps, Jack a fabriqué un fusil qui rompt la communication entre les blocs qui composent les Réplicateurs. C'est un atout indéniable...