Le 29 octobre 1965, Mehdi Ben Barka, l'un des principaux opposants au roi Hassan II du Maroc, disparaît. Son cadavre n'a jamais été retrouvé, et cette affaire a longtemps envenimé les relations diplomatiques franco-marocaines. Aujourd'hui encore, cinquant ans après les faits, le mystère reste entier quant aux circonstances de sa mort, et il apparaît clairement dans le dossier de l'instruction que le pouvoir marocain s'oppose à l'établissement de la vérité. Le documentaire propose un éclairage nouveau sur cette affaire, son instruction, mais également son contexte historique et politique.