Fanny Agostini prend la direction du massif du Jura et rejoint le réalisateur Luc Jacquet sur le plateau de Retord, dans un lieu symbolique à ses yeux. Le duo découvre ensuite les travaux de réhabilitation effectués dans le marais de Vaux. La visite du territoire se poursuit sur le massif du Grand Colombier, qui abrite une forêt exceptionnelle d'ordinaire interdite au public. Pour conclure son périple, Fanny Agostini a le privilège de participer à un moment rare : la réintroduction d'un lynx boréal.