A la fin du XIXe siècle, le chimiste Louis Pasteur a l'intuition que des micro-organismes pourraient être à l'origine des maladies infectieuses. Mais c'est à un total inconnu que l'on en doit la démonstration scientifique : médecin de campagne, Robert Koch est parvenu à identifier la bactérie responsable de la fièvre charbonneuse. En 1881, Pasteur inocule une forme atténuée de la maladie du charbon à une cinquantaine de moutons. La campagne de vaccination est couronnée de succès. Mais Pasteur omet de mentionner les travaux de Koch. Tuberculose, choléra, rage, peste, diphtérie : à travers leur duel, la lutte contre les pandémies de l'époque connaît des avancées spectaculaires.