1972. Des athlètes israéliens sont massacrés à Munich. Un agent du Mossad est chargé de retrouver et d'éliminer les membres de "Septembre noir".
A Munich, en 1972, un commando de terroristes palestiniens affilié au groupe "Septembre noir" prend en otages des athlètes israéliens. L'opération tourne au carnage. Aussitôt, Golda Meir, Premier ministre israélien, prend la décision de répliquer. Avner, un jeune agent du Mossad, reçoit l'ordre de retrouver et d'éliminer les membres de "Septembre noir" qui sont considérés comme les commanditaires de l'attentat. Il change d'identité et quitte Tel Aviv en laissant sa femme enceinte. Arrivé en Europe avec un commando de quatre hommes, il tente d'entrer en contact avec le mystérieux "Papa", qui devrait lui permettre de localiser les terroristes...
Une fois de plus, Spielberg étonne, en proposant, après le spectaculaire "Guerre des mondes", une vision très personnelle d'un monde envahi par la terreur. Un film fort et intelligent, inspiré de l'opération Colère de Dieu.