En voulant sauver Aelita d'une attaque de la Méduse, Yumi se retrouve aux prises avec le monstre. Rapidement, Jeremy constate que suite à cette attaque, Yumi ne peut plus être dévirtualisée. En fait, il lui manque une partie d'elle-même : son code ADN virtuel. Comment faire pour le lui redonner ? Après de nombreuses recherches, les héros comprennent que la seule solution est d'aller chercher ce chaînon manquant dans XANA lui-même...