Tony et Ziva partent en Colombie, où ils sont rejoints par le mentor de Ziva. Ils sont à la recherche d'un lieutenant et d'un aumônier de la Marine.
Le NCIS enquête sur le meurtre du lieutenant Larabee, un marine dont le corps a été jeté depuis un avion de la Navy. D'après les premiers éléments, l'homme aurait été tué avant la chute. Les membres de l'équipe découvrent sur la victime une pièce commémorative d'une femme aumônier, missionnaire portée disparue en Colombie. Une moisissure assez rare permet de localiser exactement la région d'où elle provient. Tony et Ziva se rendent sur place pour mener l'enquête avec Monique Lisson, ancien agent d'Interpol et mentor de Ziva en proie aux cartels de drogue colombiens. De son côté, DiNozzo apprend que le vol a été officieusement organisé par la CIA...