Reese tente par tous les moyens de retrouver la trace de Finch, enlevé par la mystérieuse Root. Mais la machine l'aiguille sur une autre affaire.
Finch a été enlevé par Root. Pour le retrouver, Reese fait appel à la machine, qui lui communique un nouveau numéro. Reese s'aperçoit bientôt que ce nombre n'a en fait aucun lien avec la disparition de son ami. Il ne s'agit que d'un nouveau numéro, semblable à tous les précédents. En l'absence de Finch, Reese devient l'alternative, l'accès de secours pour la machine. Et il apprend que Finch avait interdit à la machine de veiller sur lui. Reese se retrouve obligé de sauver Leon Tao, un comptable poursuivi par la Nation aryenne car il a détourné une partie de son argent sale. Il finit par menacer la machine de tout arrêter si elle n'enfreint pas les règles et si elle refuse encore de l'aider à retrouver Finch. La machine lui communique un nouveau, numéro, celui d'une jeune fille de 14 ans, disparue au Texas de nombreuses années plus tôt...