Le leader d'une révolution démocratique est arrêté par des agents à la solde des pays de l'Est. L'équipe de Jim Phelps tente de faire échouer leurs plans.
Le père Paolo Dominguin est le leader d'une révolution démocratique dans son pays. Mais un militant local, Carlos Martillo, allié à Juan Acero, un agent des pays de l'Est, capture Dominguin et l'enferme, pour reprendre la tête de son mouvement et installer une dictature. L'équipe de Mission impossible intervient pour les stopper et tente de profiter de la rivalité qui oppose Carlos Martillo et Juan Acero. Jim se fait passer pour un important trafiquant d'armes américain et propose aux deux hommes une grande quantité de munitions. Acero accepte la proposition et fait prisonniers Jim et son coéquipier, Willy...